Làm thế nào chúng ta có thể phân loại rất nhiều loài vi khuẩn?
Mặc dù các sơ đồ này cho phép xác định và phân loại các chủng vi khuẩn, nhưng vẫn chưa rõ liệu những khác biệt này có thể hiện sự khác biệt giữa các loài khác nhau hay giữa các chủng của cùng một loài hay không.