Do sự tự do, các bộ mã hóa khác nhau có thể mang lại chất lượng khác nhau ngay cả khi khía cạnh nào của tệp giống nhau?
Bên cạnh tốc độ bit của đoạn âm thanh được mã hóa, chất lượng của tệp MP3 còn phụ thuộc vào chất lượng của bộ mã hóa và độ khó của tín hiệu được mã hóa.