Do sự tự do, các bộ mã hóa khác nhau có thể mang lại chất lượng khác nhau ngay cả khi khía cạnh nào của tệp giống nhau?
Vì tiêu chuẩn MP3 cho phép khá tự do với các thuật toán mã hóa nên các bộ mã hóa khác nhau có thể có chất lượng khá khác nhau, ngay cả với tốc độ bit giống nhau.