Kyoto đơn giản có nghĩa là Thủ đô mặc dù ban đầu nó được gọi là Heian-kyo (Thủ đô hòa bình), tên được đặt cho thời đại Heian hoàng kim giữa thế kỷ thứ 10 và 12.
Kyoto có nghĩa là Địa ngục, một cái tên do các thương gia Trung Quốc đặt.