Nó bao gồm bốn hòn đảo chính, do Honshu thống trị, với Hokkaido ở phía bắc, Shikoku trên Biển nội địa hẹp và Kyushu ở phía tây nam.
Nhật Bản là 4 hòn đảo riêng biệt trải rộng trên một diện tích rộng lớn.