Santorini trông giống hệt như nhiều hòn đảo khác ở Cyclades cho đến khoảng năm 1500 trước Công nguyên. , khi một vụ phun trào lớn của núi lửa đã cuốn toàn bộ phần bên trong hòn đảo vào bầu khí quyển, làm thay đổi khí hậu trái đất trong nhiều năm sau đó.
Núi lửa đã phun trào trong hơn mười giờ cho đến khi tắt hẳn.