Do đó, khi áp dụng các thước đo phần mềm vào công việc kiểm toán, cần phải cẩn thận tuân theo các tiêu chuẩn kiểm toán được chính phủ chấp nhận chung khi đưa ra kết luận dựa trên kết quả của các thước đo phần mềm.
Các thước đo phần mềm đôi khi có thể gây ra sai sót khi áp dụng vào công việc kiểm toán.