Nhưng mối đe dọa của những người theo đạo Luther, những người theo chủ nghĩa Calvin và những kẻ dị giáo khác đã chuyển trọng tâm sang đàn áp, lên đến đỉnh điểm là Cuộc phản cải cách được chính thức tuyên bố vào năm 1563.
Sự đàn áp trở thành điểm nhấn do sự đe dọa của các nhóm dị giáo.