Koko-en thực tế bao gồm chín khu vườn riêng biệt, mỗi khu vườn có một chủ đề đặc biệt như tre, cây thông, cây con, cây mùa hè và hoa.
Koko-en bao gồm ba khu vườn riêng biệt, tất cả đều theo chủ đề tre.