Nhưng các chương trình Java vẫn chậm hơn đáng kể so với các chương trình được viết cho một hệ điều hành cụ thể, cũng như các sinh vật lưỡng cư không giỏi trên cạn bằng động vật có vú hoặc dưới nước tốt như cá.
Khả năng tốc độ chậm hơn của Java khiến nó trở thành một lựa chọn không được ưa chuộng so với các chương trình được viết cho một hệ điều hành cụ thể.