Vương cung thánh đường San Francesco trên thực tế là hai nhà thờ, nhà thờ này nằm trên nhà thờ kia, được xây dựng trên ngôi mộ đơn giản của vị thánh trong hầm mộ.
Một trong những nhà thờ được dựng lên trên lăng mộ của vị thánh.