Phần nổi bật nhất của bảo tàng là Đền Sách, có cấu trúc hình nón màu trắng lấp lánh tượng trưng cho hình dạng của nắp lọ, nơi phát hiện ra các bản thảo Kinh thánh lâu đời nhất thế giới, Cuộn giấy Biển Chết.
Đền Sách được đặt trong một căn phòng hình khối vuông vức.