Ngoài việc nhận ra tính chất hóa học phức tạp của khí quyển có liên quan đến một số chất gây ô nhiễm, các nhà lập mô hình chất lượng không khí cũng phải giải quyết những điều không chắc chắn liên quan đến khí tượng thay đổi và sự phân bố khí thải theo không gian và thời gian.
Người lập mô hình chất lượng không khí phải có khả năng nhận biết tất cả các chất gây ô nhiễm.